Wird die physiologische Darmflora gestört (z.B. durch Antibiotika) kommt es zu einer Ausbreitung von C. difficile im Darmtrakt. Krankheitsauslösend wirken dabei die vom Erreger produzierten Toxine (Entertoxin A und Cytotoxin B), welche die Darmzellen schädigen. Die Symptome reichen von einer leichten Diarrhö bis hin zu einer pseudomembranösen Kolitis.

Das Screening erfolgt mit Clostridium spp. spezifischem Glutamatdehydrogenase-Antigen (GDH) , die Bestimmung des Toxins A/B erfolgt bei positivem GDH anschliessend mit PCR.